หลายคนสงสัยว่า "การสวนทวารเพื่อล้างพิษ" โดยใช้กาแฟบริสุทธิ์ จะทำให้เกิดโทษ หรือลำไส้มีปัญหาได้หรือไม่
ทางการแพทย์ ไม่แนะนำให้ใช้วิธีสวนล้างลำไส้ด้วยกาแฟ ขึ้นอยู่กับวิจารณญาญของผู้ที่ต้องการทำเป็นหลัก ยังไม่มีผู้ที่ทำวิจัย หรือศึกษาเรื่องนี้อย่างเป็นทางการถึงผลเสียที่อาจเกิดขึ้น
ปกติแล้ว ในทางการแพทย์ จะทำการสวนล้างเฉพาะในกรณีที่คนไข้ จะต้องทำเอกซเรย์ ทางเดินอาหารและลำไส้ ในกรณีที่มีท้องผูก หรือจะทำการผ่าตัด เป็นต้น และจะทำเฉพาะในกรณีที่แพทย์สั่งให้ทำเท่านั้น
การสวนล้างลำไส้ด้วยตนเองนั้น อาจทำให้เกิดการระคายเคืองต่อทางเดินอาหารและลำไส้ และอาจทำให้เกิดการติดเชื้อที่ลำไส้ได้ ทั้งจากอุปกรณ์ที่ใส่เข้าไป และจากสิ่งที่ใส่เข้าไปเพื่อสวนล้าง และจากความสะอาดของสิ่งที่ใส่เข้าไป
ในทางการแพทย์การทำบ่อยๆ นอกจากระคายเคือง อาจเป็นส่วนหนึ่งที่ทำให้เกิด การกระตุ้นทำให้เกิดมะเร็งได้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่มีปัญหาเกี่ยวกับลำไส้ เพราะหากลำไส้ทะลุจากการสวนลำไส้ อาจทำให้มีผลเสียตามมาอย่างมากโรงพยาบาลกรุงเทพ